Геном золотої рибки

Золота рибка – відомий казковий персонаж, що виконує бажання в обмін на свободу. Але є і справжні золоті рибки – поширені акваріумні мешканці Carassius auratus. Історія доместикації цього виду налічує близько тисячі років. Саме спостереження за варіативністю одомашнених золотих рибок навело Чарльза Дарвіна на ідею відбору. Учені взялися детально дослідити їх ДНК.

Ядерна ДНК золотих рибок зібрана у 50 пар хромосом. Проаналізували геном 185 представників різних варіацій цього виду, а також 16 диких карасиків, які, як видно з латинської назви, є родичами. Порівняння прочитаного із геномами інших риб дозволило уточнити особливості еволюції золотих рибок. Зокрема, 13-15 млн років тому відбулося подвоєння хромосомного набору, а розділення ліній предків сучасних карпів та карасів відбулося 12-13 млн років тому.

Дослідники також спробували встановити гени (чи фрагменти геному), пов’язані із найбільш визначними особливостями різновидів золотих рибок: відсутності спинного плавця, подвоєння анального плавця чи форми хвоста. Однією з таких ознак є прозорість тіла. Уперше такі мутанти описані у 1579 році. Надалі було встановлено приблизний регіон, де має міститися відповідний ген, але не було встановлено, який саме. Зараз дослідники встановили, що найімовірніше, ним є рецепторна тирозин кіназа – мембранний білок, що опосередковує вплив багатьох ростових факторів. Його аналог в інших організмів бере участь в регуляції активності меланоцитів, а відтак впливає на забарвлення. Валідизація цього відкриття все ще триває, а коли завершиться, дана ознака стане ще одним підтвердженим випадком менделівського успадкування. Саме того, що у школі 3:1 🙂

Автори зазначають, що знання повного геному золотої рибки робить її перспективним лабораторним об’єктом для вивчення функціональної геноміки та закономірностей процесу доместикації.

Джерело: Chen D, Zhang Q, Tang W, Huang Z, Wang G, Wang Y, Shi J, Xu H, Lin L, Li Z, Chi W, Huang L, Xia J, Zhang X, Guo L, Wang Y, Ma P, Tang J, Zhou G, Liu M, Liu F, Hua X, Wang B, Shen Q, Jiang Q, Lin J, Chen X, Wang H, Dou M, Liu L, Pan H, Qi Y, Wu B, Fang J, Zhou Y, Cen W, He W, Zhang Q, Xue T, Lin G, Zhang W, Liu Z, Qu L, Wang A, Ye Q, Chen J, Zhang Y, Ming R, Van Montagu M, Tang H, Van de Peer Y, Chen Y, Zhang J. The evolutionary origin and domestication history of goldfish (Carassius auratus). Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Nov 24;117(47):29775-29785. doi: 10.1073/pnas.2005545117

Залишити відповідь

Ваша e-mail адреса не оприлюднюватиметься. Обов’язкові поля позначені *